蒙族醫藥是以蒙古民族長期同疾病作斗爭中所積累的傳統醫療實踐經驗為基礎，吸收藏醫及印度醫學的部分基本理論和漢族醫學的知識，在樸素的唯物論和自發的辯證法思想影響和指導下，逐步形成的獨特的民族醫學，它把人體看作是一個對立統一的有機整體，從宏觀的角度來研究人體動態的各種內在聯系，從而闡明生命運動的基本規律。在臨床上，它主要采取綜合、分析和判斷的方法對疾病進行診治。

　　蒙醫藥理論體系的顯著特點是：以陰陽五元學說哲學思想為指導的整體觀和對六基癥的辨證施治。六基癥理論把引起疾病的主要原因歸納為“赫依、希拉、巴達干、血液、黃水、粘蟲”等六種。把疾病的本質歸納為寒熱兩種，把發病部位歸納為臟腑、黑脈、白脈、五官等。

　　蒙醫理論明確指出，發病本身的內在條件是指三根七素，即內因，致病因素指外界因素，即外緣。在正常情況下，三根七素各有特點，自具其能，密切聯系，共同擔負著人體正常生理功能活動，保持對立統一的相對平衡狀態。這是人體健康的基本原因。在各種致病因素的影響下，三根出現偏盛偏衰等反常狀態而失去平衡時，就產生疾病，這是病理活動的基本原因。三根七素是人體進行生命活動的能量與物質基礎，并且也是產生一切疾病的根本因素。對于人體生理功能和病理機制，均以三根的生成變化為理論根據。近代蒙醫將發病的根源歸納為赫依、希拉、巴達干、血液、黃水、粘蟲6種，它是疾病發生的內因，并由此引起的疾病稱為六基癥。

一、生理

　　蒙醫認為，人體的生命現象，是一個綜合性的復雜的活動過程，內部消化系統，外部言聽視行，都不是孤立進行的，必須在三根七素的作用下，人體臟腑之間、臟腑與體表之間的生命活動彼此協調，相互制約，才能維持人體內環境的相對平衡，如某一部分發生病變，就會影響到其他部分以至整體，引起平衡失調，功能障礙，出現一系列癥狀。所以在醫療疾病過程中，不能只看表面現象，而要辨證地進行全身的綜合分析才能得出正確的診斷。人和自然界也是相互對立統一的，人體通過感受器官和外界自然環境保持著密切聯系，自然環境的變化，必然對人體產生影響。在正常的情況下，通過人體內部三根的調節，使與自然環境的變化相適應，保持正常的生理功能。

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