督脈主要生理功能包括以下三點：

　　一是督脈為原氣所發，能溫煦臟腑，敷布命火。督脈起于小腹正中，正當“丹田”，為男子藏精、女子蓄血之處，即如《針灸大成》督脈條言：“督任原是通真路”，指督脈為原氣所發，是翰旌元氣的通路；督脈聯絡諸經，且通過其分支與腎相連，腎為命門之所在，內藏元陽，為全身臟腑器官動力之源，且元陽要借助于任督之脈通行而布達全身。

　　二為“陽脈之海”，總督諸陽。督脈循行于背部正中線，背為陽能聯系手三陽經和足三陽經，使陽經之氣都交會于督脈的大椎穴；帶脈出于第二腰椎，陽維脈會于風府、啞門，督脈與之均有聯系，所以，督脈為“陽脈之總綱”和“陽脈之海”，能調節全身陽經，總督一身陽經之脈氣。

　　三是反映腦髓的功能。督脈與腦髓關系最為密切，《靈樞·經脈》載：“督脈者……與太陽起于目內眥，上額交巔，入絡腦，還出別下項。”《難經·二十八難》亦云：“督脈者，起于下極之俞……入屬于腦”。《內經》、《難經》早期的論述，即初步闡明了督脈在循行上與腦髓的密切關系，督脈的循行決定了其和腦髓的密切關系，且與現代解剖學中腦和脊髓的部位和功能相當吻合。所以循行于脊髓和腦的督脈反映并代表著脊髓的絕大部分功能。

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