藥物是中醫理、法、方、藥的重要環節。藥物治病的基本作用主要是祛除病邪，消除病因恢復臟腑功能的協調，糾正陰陽偏勝偏衰的病理現象，使機體在最大程度上恢復到正常狀態。中藥的臨床運用，須在臟腑經絡、病因病機等中醫基礎理論指導下，通過辨證求因，審因論治，辨證立法，然后以法為準則，進行遣方用藥。只有藥物的選擇與證候吻合，體現了治療法則，才能取得良好的臨床效果。

眼科對藥物的應用有一定的特殊性，某些藥物如退翳障藥為眼科特有，而外用藥的使用更具專科特點。一般藥物書籍中未明確列出藥物在眼科的應用，掌握眼科用藥的特殊性和特點是臨床眼科學的基礎。以下將眼科常用藥物按功能分為祛風藥、清熱藥、祛濕藥、化痰藥、開竅藥、平肝藥，理氣藥、止血藥，活血祛瘀藥、溫里藥、補益藥、退翳障藥及外用藥等簡述于后。

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